Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RD3LP0DJH9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RD3LP0DJH9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms