Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC172P0C7W6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms