Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PKHD1P08F94 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms