Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDN1P05305 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDN1P05305 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDN1P05305 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDN1P05305 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDN1P05305 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDN1P05305 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDN1P05305 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDN1P05305 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms