Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGAP02671 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGAP02671 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGAP02671 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGAP02671 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGAP02671 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGAP02671 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms