Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX58O95786 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX58O95786 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX58O95786 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX58O95786 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX58O95786 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX58O95786 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX58O95786 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX58O95786 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX58O95786 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX58O95786 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX58O95786 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX58O95786 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX58O95786 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX58O95786 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms