Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALX3O95076 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALX3O95076 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALX3O95076 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms