Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCF11O94913 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCF11O94913 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCF11O94913 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCF11O94913 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCF11O94913 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCF11O94913 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PCF11O94913 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCF11O94913 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCF11O94913 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCF11O94913 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms