Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN7O94888 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms