Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA4O75335 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms