Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NIPSNAP2O75323 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms