Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms