Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GMDSO60547 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMDSO60547 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms