Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCA5O60264 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms