Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALUO43852 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALUO43852 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALUO43852 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALUO43852 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALUO43852 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALUO43852 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALUO43852 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALUO43852 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALUO43852 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALUO43852 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CALUO43852 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms