Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR2O43760 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR2O43760 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYNGR2O43760 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms