Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB2O43741 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms