Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNQ2O43526 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms