Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CRXO43186 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CRXO43186 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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