Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APAF1O14727 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APAF1O14727 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APAF1O14727 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APAF1O14727 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APAF1O14727 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms