Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF5O00463 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF5O00463 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms