Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLIM4O00461 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms