Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms