Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYNX1G3V0Z9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms