Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms