Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVV-2B6SEH9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms