Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms