Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms