Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PALM3A6NDB9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms