Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L4A6NCW7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms