Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms