Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP16Q9Y5T5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms