Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHAC2Q9Y5I4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHAC2Q9Y5I4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms