Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms