Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RAD54L2Q9Y4B4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms