Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC4Q9Y296 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms