Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNQ9UQP3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms