Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAPRE3Q9UPY8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms