Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms