Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CROTQ9UKG9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms