Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MRTO4Q9UKD2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms