Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCAN3Q9UKA8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCAN3Q9UKA8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms