Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN2Q9UHV9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms