Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms