Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms