Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT172Q9UG01 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms