Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPASTQ9UBP0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms