Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CC2D2AQ9P2K1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CC2D2AQ9P2K1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms