Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms