Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms